Na základe nového očkovacieho kalendára platného od 1. januára 2009 je očkovanie proti pneumokokovým invazívnym ochoreniam súčasťou povinného očkovania. Rozhodol o tom Úrad verejného zdravotníctva SR na základe vyhlášky Ministerstva zdravotníctva SR o kontrole a prevencii prenosných ochorení. Detský lekár zaočkuje proti pneumokokovým infekciám každé dojča narodené v tomto roku troma dávkami vakcíny, pričom očkovať sa začína v treťom mesiaci života. Toto povinné očkovanie je plne hradené zo zdravotného poistenia. Očkovanie proti pneumokokom konjugovanou vakcínou je zároveň od 1. januára 2009 plne hradené deťom do 5 rokov veku, ktoré patria do rizikových skupín. Rizikové skupiny definuje presný zoznam lekárskych diagnóz. Ide napríklad o deti s nízkou pôrodnou hmotnosťou, predčasne narodené deti či deti s rôznymi chronickými ochoreniami dýchacích ciest, srdca alebo poruchami imunitného systému. Zdravotné poisťovne hradia konjugovanú vakcínu proti pneumokokom aj deťom narodeným v roku 2007 a 2008, u ktorých bolo očkovanie začaté ešte v minulom roku a je potrebné očkovanie ukončiť podľa schválenej schémy očkovania. O hradení vakcíny deťom narodeným v mesiacoch október až december roku 2008, u ktorých sa očkovanie v minulom roku pre vek dieťaťa ešte nemohlo začať, rozhodli jednotlivé zdravotné poisťovne individuálne.